Die Heeresstruktur 2 hatte ab April 1959 direkte Auswirkungen auf das Bataillon. Zum einen wurde es ab dem 01. April 1959 in Flugabwehrbataillon 3 (Stabs- und VersBttr, zwei Schießende, mit M42 ausgerüstete FlakBttr´n sowie die AusbBttr 3/3)umbenannt und dem Artillerieregiment 3 der 3.Panzerdivision direkt unterstellt. Zum anderen entstanden durch die erhebliche Personal- und Materialabgaben des Bataillons neue, selbstständige Brigadeflugabwehrbatterien (BrigFlaBttr), die den Brigaden der 3.PzDiv direkt unterstellt wurden. So hatte das FlaBtl 3 die BrigFlaBttr 80 aufzustellen, die mit Hilfe der Personalabgabe der zwei schießenden Batterien entstand und im Mai 1959 nach Lüneburg in die Scharnhorst-Kaserne verlegte. Aus der im Frühjahr 1958 aufgestellten AusbBttr 3/3 wurde ebenfalls ab April 1959 die selbstständige BrigFlaBttr 70, die der Brigade 7 direkt unterstellt wurde, jedoch im Standort Uesen verblieb.Am 23. Oktober 1959 konnte Oberstleutnant Schüler anläßlich der Kommandoübergabe an den neuen Kommandeur, Oberstleutnant Robert Hahn zu Recht vor seinen angetretenen Soldaten feststellen, dass “Wir alle zusammen das Fundament unseres Bataillons gebaut haben. Und wenn wir uns selbstkritisch fragen, ob es ein gutes und solides geworden ist, dann dürfen wir ruhigen Gewissens mit “Ja” antworten und ein klein wenig Stolz darauf sein.” Noch vor der Bataillonsübergabe wurde am 01. August 1959 eine Steinplastik vor dem Wirtschaftsgebäude aufgestellt und der Truppe übergeben. Drei überlebensgroße, mit Schild gewappneten “Krieger” sollten möglicherweise die Verteidigungsbereite NATO oder die Zugehörigkeit zur “DRITTEN” Division symbolisieren, doch bei den Fla-Soldaten hießen die Betonkrieger schnell nur noch